經濟局負責管理和協調兩岸“三通”事務；統籌協調和指導對臺經濟工作；研究協調對臺商投資和赴臺投資的政策；會同有關部門研究、草擬對臺經濟、貿易、金融、科技等方面的法律、法規、政策，并負責協調和檢查落實；會同有關部門和地方協調對臺重要經貿項目和活動；指導、管理臺資企業協會，負責對臺資企業的政策指導及服務工作。